Matthew Timothy Healy dilahirkan pada 8 April 1989 di Hendon, utara London.[1][2] Dia ialah anak kepada pelakon Tim Healy[3] dan Denise Welch; mereka bercerai pada 2012.[4] Adik lelakinya, Louis, ialah seorang pelakon.[5] Kedua-dua ibu bapanya berketurunan Ireland.[6] Dia tinggal di Melbourne, Australia dari umur dua hingga empat tahun[7] tetapi menghabiskan sebahagian besar tahun awalnya tinggal di ladang lembu di Hedley on the Hill, Northumberland.[8][9] Keluarga itu berpindah ke Alderly Edge di Cheshire ketika berumur sembilan tahun.[10]

Ibu bapa Healy bekerja sebagai pelakon pentas dan televisyen untuk sebahagian besar zaman kanak-kanaknya, dengan ibunya menjadi tokoh selebriti pada usia remajanya.[11] Dia sendiri tidak berminat untuk berlakon,[5] tetapi muncul sebagai tambahan dalam rancangan televisyen ibu bapanya termasuk Coronation Street,[12] Byker Grove[13] dan Waterloo Road.[14] Ibu bapanya merupakan peminat muzik, dan memperkenalkannya kepada muzik soul dan Motown,[15][16][17] dan bapanya bersosial dengan ramai pemuzik termasuk Brian Johnson dari AC/DC (yang menjadi bapa baptis Healy),[18] Rick Wakeman dari Yes, Mark Knopfler dari Dire Straits, dan Jeff Lynne dari Electric Light Orchestra.[16] Peter Hook dari Joy Division dan New Order pula berjiran dengan mereka.[19] Bapa baptis ibunya, penulis skrip Ian La Frenais, memperkenalkannya kepada Ringo Starr.[20] Gitar pertama Healy pernah dimainkan digunakan oleh Dire Straits untuk merakam "Romeo dan Juliet".[21] Dia telah berkata jarak awal ini dengan pemuzik bermakna kemungkinan "menjadi bintang rock adalah sebahagian daripada realiti saya."[22]

Healy adalah seorang kanak-kanak yang pendiam, dan mengalami mimpi buruk yang berulang.[20] Dia mendapat kit dram pertamanya ketika berusia lima tahun,[23] dan mula melakukan karate pada usia tujuh tahun akhirnya memperoleh tali pinggang hitam pada usia remajanya.[24][25] Selama 12 tahun pertama hidupnya, dia merupakan anak tunggal, "jadi terdapat banyak permainan video, banyak video Michael Jackson, banyak menyanyi dan menari untuk diri saya sendiri dan penglibatan diri."[26] Tidak seperti adik lelakinya,[5] Healy "dibesarkan di rumah parti"[16] dan telah teringat tidur "di bar" Groucho Club di London dalam banyak kesempatan.[27] Dia telah mengingati aspek zaman kanak-kanaknya sebagai "menarik" berbanding "menyusahkan."[16] Kedua-dua ibu bapanya mempunyai masalah dengan alkohol,[16] dan ibunya menggunakan kokaina untuk mengubati sendiri semasa tempoh kemurungan akut, termasuk selepas bersalin.[28]

Healy mendapat pendidikan swasta di Lady Barn House School[29] dan King's School, Macclesfield; dia kemudiannya dibuang dari King's School kerana memulakan geng pergaduhan.[17][6] Dia memenangi pertandingan bakat King's School pada usia 12 tahun, dengan persembahan lagu oleh The La's dan Oasis, dan memberitahu akhbar tempatan bahawa dia berharap "menjadi penyanyi pop" apabila dewasa.[30] Dia kemudiannya berpindah ke Sekolah Tinggi Wilmslow, di mana dia bertemu dan berkawan dengan rakan sekumpulan masa depannya.[28] Bertahun-tahun kemudian, Healy memanggil sekolahnya sebagai "pemberian yang membosankan, dan menghalang saya menjadi bintang pop".[16] Dia keluar sekolah pada usia 16 tahun dengan dua GCSE.[31] Dia kemudiannya menghadiri kolej muzik selama tiga bulan sebelum berhenti.[32] Laman web Akademi Muzik Kontemporari menyenaraikan Healy sebagai alumni 2007–2008, memperoleh diploma vokal.[33][34]